Τρισάγιο υπέρ αναπαύσεως του Ιωάννη Καποδίστρια τελέστηκε το πρωΐ της Πέμπτης 31 Ιανουαρίου 2013 στην Ιερά Μονή Πλατυτέρας στην Κέρκυρα από τον ιερομόναχο π.Γεώργιο Αλευρά, πνευματικό της Ιεράς Σκήτης Αγίας Τριάδος Καυσοκαλυβίων Αγίου Όρους και προέδρου της "Ελαίας" ΑΜΚΕ, η οποία έχει αναλάβει την πρωτοβουλία προβολής του πρώτου μεταβυζαντινού Κυβερνήτη της Ελλάδος, μέσα από τη ζωή, το έργο και όλες τις επιστολές του, οι οποίες πρόκειται να εκδοθούν σύντομα.
Επίσης συνάντηση σε θερμό κλίμα πραγματοποιήθηκε στην Ιερά Μητρόπολη Κέρκυρας μεταξύ του σεβ.Μητροπολίτη Κερκύρας, Παξών και Διαποντίων Νήσων κ.κ Νεκταρίου, του συγγραφέα και δ/ντα συμβούλου της Ελαίας ΑΜΚΕ κ.Κορνιλάκη Ιωάννη, του Υφυπουργού Εθνική Άμυνας κ. Δημήτρη Ελευσινιώτη και του ιερομονάχου και προέδρου της Ελαίας ΑΜΚΕ π.Γεωργίου Αλευρά της Ιεράς Σκήτης Αγίας Τριάδος Καυσοκαλυβίων Αγίου Όρους
Ἔτι δεόμεθα ὑπὲρ ἀναπαύσεως τῆς ψυχῆς τοῦ κεκοιμημένου δούλου τοῦ Θεοῦ Ιωάννου καὶ ὑπὲρ τοῦ συγχωρηθῆναι αὐτοῦ πᾶν πλημμέλημα ἑκούσιόν τε καὶ ἀκούσιον.
Ὅπως Κύριος ὁ Θεὸς τάξῃ τὴν ψυχὴν αὐτοῦ ἔνθα οἱ Δίκαιοι ἀναπαύονται, τὰ ἐλέη τοῦ Θεοῦ, τὴν βασιλείαν τῶν οὐρανῶν, καὶ ἄφεσιν τῶν αὐτοῦ ἁμαρτιῶν, παρὰ Χριστῷ τῷ ἀθανάτῳ Βασιλεῖ καὶ Θεῷ ἡμῶν αἰτησώμεθα.
Ἔτι δεόμεθα ὑπὲρ ἀναπαύσεως τῆς ψυχῆς τοῦ κεκοιμημένου δούλου τοῦ Θεοῦ Ιωάννου καὶ ὑπὲρ τοῦ συγχωρηθῆναι αὐτοῦ πᾶν πλημμέλημα ἑκούσιόν τε καὶ ἀκούσιον.Ὅπως Κύριος ὁ Θεὸς τάξῃ τὴν ψυχὴν αὐτοῦ ἔνθα οἱ Δίκαιοι ἀναπαύονται, τὰ ἐλέη τοῦ Θεοῦ, τὴν βασιλείαν τῶν οὐρανῶν, καὶ ἄφεσιν τῶν αὐτοῦ ἁμαρτιῶν, παρὰ Χριστῷ τῷ ἀθανάτῳ Βασιλεῖ καὶ Θεῷ ἡμῶν αἰτησώμεθα.
